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Pattern Ag anuncia o maior banco de dados metagenômico do mundo
18 de setembro de 2023
2 minutos
Pattern Ag anuncia o maior banco de dados metagenômico de ecossistema único do mundo
A Pattern Ag criou o maior banco de dados metagenômico do mundo voltado para o solo, com mais de 43 bancos de dados
A Pattern Ag planeja expandir seus esforços futuros de sequenciamento e análise para incluir amostras de todo o mundo e criar o primeiro mapa global do microbioma do solo
A Pattern Ag está explorando ativamente microrganismos desconhecidos do solo para descobrir a matéria escura microbiana e liberar o poder das soluções biológicas na agricultura
EMERYVILLE, Califórnia - A Pattern Ag opera o maior banco de dados metagenômico do mundo, aproveitando dados de solo de mais de 43 bancos de dados. Esse banco de dados é maior e mais significativo do que o banco de dados Tara Oceans, disponível ao público - uma parceria acadêmica multinacional que levou cinco anos para ser construída - e a Pattern Ag continua aumentando seu próprio banco de dados.
"A escala do banco de dados da Pattern Ag é fundamental, pois permite novas soluções computacionais na agricultura", disse Rob Hranac, CEO da Pattern Ag. "Essa escala única de dados em solos agrícolas nos permite prever resultados agronômicos com mais precisão do que era possível anteriormente, liberando o poder da agricultura preditiva para nossos clientes."
A Pattern Ag foi fundada em 2018 e logo depois começou a construir seu banco de dados. À medida que o trabalho avançava, a Pattern Ag coletou amostras e começou a realizar testes de DNA no solo. Hoje, a Pattern Ag coleta e analisa amostras de solo de todo o Centro-Oeste, acrescentando continuamente profundidade ao seu enorme banco de dados. A empresa planeja ampliar o escopo desse esforço para incluir a análise de amostras de solo de todo o mundo, com uma visão de longo prazo de criar o primeiro mapa global do microbioma do solo.
"Uma das principais limitações da nossa capacidade de entender o microbioma do solo são os dados genômicos disponíveis em escala", disse Hranac. "Normalmente, os pesquisadores têm sido limitados por modelos de laboratório de baixo rendimento que lhes permitem estudar microbiomas isoladamente. A Pattern criou uma fábrica de dados genômicos exclusiva para solos, criando análises biológicas para a colocação de produtos e investindo em plataformas robóticas avançadas para processar dados do solo em escala."
Um exemplo do poder do banco de dados metagenômico do Pattern Ag é o Predictive Ag Report anual lançado recentemente pela empresa, que prevê os riscos de algumas das pragas mais destrutivas do mundo com 12 meses de antecedência, com mais de 90% de precisão. Essas informações permitem que os agricultores reduzam os custos associados ao controle de pragas e patógenos, incluindo o verme da raiz do milho e os nematóides de cisto da soja, levando a práticas agrícolas mais sustentáveis.
"A escala não é o único fator que torna nosso banco de dados genômico único", diz Danielle Watts, Ph.D., vice-presidente de ciência de dados da Standard. "Ao nos concentrarmos na produção de campos de milho e soja, podemos entender de forma única o contexto por trás dos genomas que estamos sequenciando. Ter metadados sobre os componentes físicos, químicos e agronômicos dos campos dos quais coletamos amostras nos dá uma capacidade única de conectar dados microbianos aos resultados dos agricultores." A fusão desses conjuntos de dados permite que a Pattern Ag reduza o tempo necessário para trazer novas percepções ao mercado e explorar novos organismos e caminhos que não haviam sido descritos anteriormente pela ciência.
De acordo com estimativas da Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação, a produção de alimentos precisará ser aumentada em 60% até 2050 para alimentar a crescente população mundial. As empresas que utilizarem os insights obtidos com o banco de dados metagenômico do Pattern Ag ajudarão a comercializar soluções inovadoras para aumentar a produção de alimentos de forma sustentável.
A Pattern Ag está solicitando ativamente parcerias do setor e acadêmicas para fazer parte do aproveitamento de seu banco de dados metagenômico para solucionar desafios agronômicos práticos para os agricultores.